Όσο αφορά στη διδακτική μεθοδολογία, το πρόγραμμα καινοτομεί ως προς την υλοποίηση της διαθεματικής/διεπιστημονικής προσέγγισης στη μελέτη του φύλου στο νέο κοινωνικο-οικονομικό και τεχνολογικό περιβάλλον.

Τα μαθήματα διδάσκονται σε συνδιδασκαλία, το καθένα από τρεις ή τέσσερις καθηγητές διαφορετικών επιστημονικών ειδικοτήτων, τόσο από το Πανεπιστήμιο Αιγαίου όσο και από άλλα πανεπιστήμια, καθώς και από άλλους/ες ειδικούς/ές εξωτερικούς/ές επιστήμονες.

Επιπρόσθετα, έχει προβλεφθεί η παροχή πρόσθευης εξ αποστάσεως φροντιστηριακής και εργαστηριακής στήριξης των φοιτητών και φοιτητριών, από μεταπτυχιακούς φοιτητές/τριες.

Όλο το πρόγραμμα υλοποιείται από απόσταση (με "σύγχρονες" και "ασύγχρονες") μορφές επικοινωνίας μεταξύ εκπαιδευτή/τριας και εκπαιδευομένου/ης), ενώ η διδασκαλία, η αμφίδρομη επικοινωνία και μαθησιακή υποστήριξη των φοιτητών/τριων πραγματοποιούνται μέσω της εκπαιδευτικής πλατφόρμας WebCT.

Για κάθε μάθημα, οι φοιτητές/τριες μπορούν στη συγκεκριμένη παλτφόρμα να βρούν:

Το διάγραμμα της ύλης που περιλαμβάνεται σε κάθε ενότητα του μαθήματος (διδακτέας και εξεταστέας).

Το εκπαιδευτικό υλικό του μαθήματος, που αποτελείται από ένα αναλυτικό σχεδιάγραμμα των διαλέξεων, εμπλουτισμένο με όποια άλλα στοιχεία κρίνονται από τους διδάσκοντες/ουσες.

Τις βιβλιογραφικές πηγές και πολλαπλές έντυπες ή/και ηλεκτρονικές συμπληρωματικές πηγές πληροφόρησης (κείμενα, ηλεκτρονικές συνδέσεις, βιβλιογραφικοί κατάλογοι, κ.ά.).

Τις προϋποθέσεις και τα κριτήρια διεξαγωγής του μαθήματος.

Τη μέθοδο αξιολόγησης. Ειδικότερα. όσον αφορά την αξιολόγηση, αυτή θα έιναι συνεχής (continuous assesment) και θα βασίζεται κυρίως στην εκπόνηση εργασιών (ατομικών ή/και ομαδικών), που θα κατατίθενται από τους φοιτητές/τριες σε τακτά χρονικά διαστήματα κατά τη διάρκεια του εξαμήνου.